嗫?暁雲?
如何找到一段mRNA序列的CDS序列
激光熔覆技术是指以不同的填料方式在被涂覆基体表面上放置选择的涂层材料，经激光辐照使之和基体表面一薄层同时熔化，并快速凝固后形成稀释度极低并与基体材料成冶金结合的表面涂层，从而显著改善基体材料表面的耐磨、耐蚀、耐热、 抗氧化及电器特性等的工艺方法。
我从网上NCBI上找到某个基因的MRNA序列,利用什么软件把它反转...
在生物学中，mRNA是由ACGU组成的序列，而cDNA是指通过反转录酶获得DNA序列，其组成为ACGT。
两者除了序列组成不同外，一个是正义链（5'-3'），一个是反义链（3'-5'）。
根据约定，所有的序列都是按照5'-3'的方向书写，所以cDNA序列应该是mRNA序列的互补，翻转序列，也就是Reverse Complement。
如果你用“Reverse Complement of Sequence”在google上搜，可以找到很多在线工具。
如果不是大量分析就不要动用Bioeditor了。
^_^ http://www.bioinformatics.org/sms/rev_comp.html至于对位排列，就是经典的clustalw/x程序吧！
已知基因序列,mrna序列,怎样用blast分析内含子和外显子
使用blastn里面的 “Align two or more sequences”，出现两个输入序列的窗口，分别输入基因组序列和mRNA序列，mRNA序列最好只选取CDS输入进去.出现比对结果后，CDS序列会和基因组相应的部分区域完好的匹配，出现几段区域就应该有几个外显子.但是这样的比对不能很好的区分内含子和外显子的边界，内含子和外显子的边界序列最好根据GT.AG规则去手动分辨，一般内含子的边界序列都有典型的特征：5'GT.AG3'，同时还要兼顾mRNA各外显子的连续性，不要出现重叠区域.
请教启动子序列预测方法
对于要分析的基因，我们需要搞清楚它的一些基本信息，第一步借助NCBI 上的Genbank查找目的基因5 端上游序列，在此以SEPT4/ARTS基因为例。
首先我们进入Genbank界面 search SEPT4 /ARTS搜索结果中第一个就是我们要的Homo sapiens目的基因，可以自己根据研究内容进行选择点击进入就可以看到该基因非常详细的信息：可以找到该基因在染色体上的定位 Location : 17q22近几年相关的研究文章 Related articles in PubMed 及它编码的四个mRNA和蛋白质我们要找的是相应的DNA 序列，点击Genbank找到相应的mRNA join(8737..8858,13841..14137,14506..14599,15038..15124 .....)及CDS join(8856..8858,13841..14137,14506..14599,15038..15124，...) 在下面对应的DNA序列中就可找到起始密码子ATG为了不遗漏启动子序列选择 ATG 上游3000bp和下游1000bp的序列进行分析，也可以根据自己的情况决定。
后面将用UCSC 和DBTSS 查找相应目的基因片段
用什么软件,可以将NCBI上下载的genome中的cds过滤出来,并同时...
有基因，你就可以直接上genebank其序列，到全序列，你需要扩增的CDS区，也就是编码区，可以全外显子扩增，这样简单一点，也可以做cDNA克隆，然后再做，前者的话就可以直接根据其基因序列NG号设计引物，如果是做CDNA的话就根据其mRNA的序列NM号设计引物. 你是根据其cDNA设计的引物，你需要下提取mRNA，然后反转录成cDNA，才能够扩增出来.如果是根据其基因序列设计的，你需要先将你的目的序列定位到GENE上，然后设计引物
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